Le CNSHB est un établissement public à caractère scientifique et administratif. A partir de recherches pluridisciplinaires, il élabore des recommandations pour son Ministère de tutelle en matière de gestion des pêches.
Avec un personnel estimé à 65 chercheurs, ingénieurs, techniciens et administrateurs, les activités du centre sont représentées par des départements de recherche que sont: le département Pêche industrielle, le département Pêche artisanale , le département Pêche Continentale, le département Socio-Economie et le département Gestion du littoral .
Les départements élaborent et mettent en oeuvre des programmes de recherche axés sur l'halieutique et la gestion des zones littorales avec l'appui de trois services techniques que sont : Le Service Administratif et Financier (SAF) ; Le service Informatique, le Service d'information et de valorisation (SIVA)
Le CNSHB a été créé en 1985 par le Gouvernement Guinéen avec l'assistance de l'Institut français de recherche scientifique pour le développement en coopération (Orstom, actuellement IRD, Institut de Recherche pour le Développement).